Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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