Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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