Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM43BQ6ZT52 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms