Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FOXD1Q16676 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
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FOXD1Q16676 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FOXD1Q16676 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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