Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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