Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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RPE65Q16518 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RPE65Q16518 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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