Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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CKAP5Q14008 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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