Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXE3Q13461 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms