Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFX1Q12986 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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