Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRMP28827 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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