Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1Q9UJ41 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1Q9UJ41 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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