Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
TMOD3Q9NYL9 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms