Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TIMMDC1Q9NPL8 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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