Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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