Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms