Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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