Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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SQLEQ14534 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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SQLEQ14534 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SQLEQ14534 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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