Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SF3B2Q13435 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SF3B2Q13435 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms