Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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