Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NME3Q13232 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NME3Q13232 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NME3Q13232 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NME3Q13232 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms