Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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