Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
IFFO1Q0D2I5 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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