Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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