Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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