Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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SGCAQ16586 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SGCAQ16586 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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