Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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