Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK4Q16099 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK4Q16099 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms