Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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