Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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PTPRRQ15256 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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PTPRRQ15256 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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PTPRRQ15256 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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PTPRRQ15256 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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PTPRRQ15256 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRRQ15256 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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