Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms