Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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