Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SEMA3FQ13275 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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SEMA3FQ13275 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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SEMA3FQ13275 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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SEMA3FQ13275 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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SEMA3FQ13275 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SEMA3FQ13275 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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