Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CASQ1P31415 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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CASQ1P31415 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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CASQ1P31415 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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CASQ1P31415 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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CASQ1P31415 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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CASQ1P31415 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CASQ1P31415 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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