Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms