Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDO1Q16878 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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