Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NTRK3Q16288 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NTRK3Q16288 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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