Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SKIV2LQ15477 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms