Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PCOLCEQ15113 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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