Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL9A2Q14055 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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