Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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APOFQ13790 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
APOFQ13790 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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