Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RUNX3Q13761 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RUNX3Q13761 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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