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| RUNX3 | Q13761 | AC103987.3-201 | ENST00000582071 | 292 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABBA01006766.1-201 | ENST00000584728 | 294 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010928.3-201 | ENST00000587712 | 541 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XIAPP1-201 | ENST00000603162 | 600 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC084782.3-201 | ENST00000612282 | 578 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC006378.2-201 | ENST00000623178 | 2476 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00890-202 | ENST00000569275 | 4595 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092447.10-201 | ENST00000620607 | 1652 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ISPD-AS1-202 | ENST00000438573 | 2252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161781.1-201 | ENST00000354277 | 403 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-35P-201 | ENST00000362782 | 153 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXNDC8-203 | ENST00000374511 | 472 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.553-201 | ENST00000384670 | 102 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SLC44A3-AS1-205 | ENST00000424505 | 612 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | EEF1B2P7-201 | ENST00000451177 | 676 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU4ATAC15P-201 | ENST00000516415 | 126 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-714P-201 | ENST00000516963 | 103 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA31.21-201 | ENST00000517180 | 77 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF279873.4-202 | ENST00000521714 | 511 nt | TSL 2 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002748.2-201 | ENST00000528671 | 348 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AHI1-217 | ENST00000534469 | 680 nt | TSL 3 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAL2-203 | ENST00000534619 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RRAS2-210 | ENST00000534746 | 993 nt | TSL 2 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PARPBP-209 | ENST00000537257 | 976 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HPRT1P3-201 | ENST00000539521 | 576 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018410.2-201 | ENST00000540410 | 610 nt | TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02461-201 | ENST00000553211 | 836 nt | TSL 3 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006362.1-201 | ENST00000567392 | 174 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069114.1-201 | ENST00000580927 | 287 nt | TSL 2 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4307-201 | ENST00000582802 | 84 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GALNT1-205 | ENST00000591081 | 1120 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC128687.1-201 | ENST00000605304 | 619 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103591.3-201 | ENST00000608684 | 209 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006111.3-201 | ENST00000622137 | 383 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SOX2-OT-255 | ENST00000630150 | 649 nt | TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STAU2-207 | ENST00000519961 | 3928 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GABRG2-208 | ENST00000638552 | 3710 nt | TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DDX6-206 | ENST00000534980 | 4538 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157700.1-201 | ENST00000561973 | 1432 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EYS-204 | ENST00000370621 | 10485 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GYPA-202 | ENST00000360771 | 2659 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XRN1-202 | ENST00000392981 | 5383 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC233263.6-201 | ENST00000631132 | 1963 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AKAP14-201 | ENST00000334356 | 608 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX43-201 | ENST00000357147 | 464 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-47P-201 | ENST00000410649 | 186 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP58-201 | ENST00000411010 | 305 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P17-201 | ENST00000411522 | 491 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL31P12-201 | ENST00000422587 | 358 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIAP1P1-201 | ENST00000427062 | 225 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL022238.1-201 | ENST00000442557 | 355 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018359.1-201 | ENST00000442567 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02195-201 | ENST00000443373 | 294 nt | TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX6CP2-201 | ENST00000444980 | 225 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099342.1-201 | ENST00000446399 | 1124 nt | TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO2P7-201 | ENST00000446518 | 666 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UQCRHP3-201 | ENST00000451503 | 251 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCEL-AS1-201 | ENST00000456280 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHRM3-AS2-203 | ENST00000458325 | 895 nt | TSL 2 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000797.1-201 | ENST00000478870 | 387 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CBX3P3-201 | ENST00000508108 | 532 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP22-201 | ENST00000508209 | 276 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CTD-2350J17.1-202 | ENST00000510456 | 360 nt | TSL 2 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.655-201 | ENST00000515919 | 96 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP43-201 | ENST00000516173 | 320 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP004371.1-201 | ENST00000525240 | 214 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002833.1-201 | ENST00000530572 | 566 nt | TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026894.1-202 | ENST00000533843 | 477 nt | TSL 5 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |