Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
IRF5Q13568 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.4 ms