Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTGDRQ13258 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTGDRQ13258 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms