Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DUSP4Q13115 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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