Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHRNEQ04844 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms