Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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