Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SOBPA7XYQ1 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SOBPA7XYQ1 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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