Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAX2Q9UIW0 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms