Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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