Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PCSK7Q16549 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms